管理部门
  

  党政办公室:负责相关党务、行政、科学传播、群团工作、安全保卫、保密工作、公共事务等工作。

  科技处:负责和协调科技管理各项工作。

  工程处:负责和协调大科学装置类工程项目(在建、运行、申报)的各项管理工作。

  资产财务处:负责和协调财务、国有资产、基本建设和后勤管理与服务工作。

  人力资源处:负责和协调研究所人力资源管理、职工继续教育、博士后、国际合作与交流和外籍专家管理与服务等工作。  

  教育处:贯彻执行国家、中科院有关研究生工作的政策和规定,负责本所研究生工作各项规章制度的起草工作并负责组织实施。

  监督审计处:负责纪检监督、审计、廉政建设和风险防控等工作。
  成果转化与产业处: 负责全所成果转化和产业化工作。
  惠州办公室:负责研究所在惠州发展涉及的各项工作、做好大科学装置建设相关的各项支撑服务等工作。

  离退休工作办公室:负责离退休人员的管理与服务工作。